Kanatlı orijinli salmonella infantis suşlarında virulens genlerinin moleküler analizi
No Thumbnail Available
Files
Date
2017
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Sağlık Bilimleri Enstitüsü
Abstract
Bu tez çalışmasında, Türkiye'de kanatlılardan yaygın olarak izole edilen S. Infantis suşlarının virulens genlerinin varlığı araştırıldı. Ayrıca S. Infantis ile S. Infantis dışındaki diğer yaygın serotiplerin sahip olduğu virulens genlerinin de karşılaştırması yapıldı. Çalışmada, farklı yetiştirme tipine sahip kümeslerin (broiler, damızlık, yumurtacı) altlık, toz, çevresel, haşlama suyu ve kemirici örneklerinden izole edilen 200 adet S. Infantis suşu ile hindi kümeslerinden gönderilen altlık, toz, çevresel, haşlama suyu ve kemirici örneklerinden izole ve identifiye edilen 24 adet S. Infantis suşu incelendi. Ayrıca, S. Infantis suşlarıyla karşılaştırma yapmak amacıyla, S. Typhimurium, S. Enteritidis, S. Kentucky ve S. Hadar suşlarının (kanatlı orijinli) her birinden 10'ar adet suş kültür koleksiyonundan temin edildi. Toplamda 224 adet kanatlı orijinli S. Infantis suşu ile S. Infantis dışındaki diğer yaygın serotiplerden 40 adet olmak üzere toplam 264 suşta virulens genleri araştırıldı. sipA, sipD, sopD, sopB, sopE, sopE2, sitC, ssaR, sifA, spvC ve pefA olmak üzere 11 adet virulens geni, 264 adet S. Infantis suşunda, konvansiyonel PCR yöntemi araştırıldı. İncelenen S. Infantis suşlarının 209'unun (%93,3) sipA, ssaR ve sopE, 208'inin (%92,85) sipD, 207'sinin (%92,41) sopB, 206'sının (%91,96) sitC, 203'ünün (%90,62) sifA, 198'inin (%88,39) sopD, 166'sının sopE2 (%74,1), 20'sinin (%8,92) spvC ve 1'inin (0,44) pefA virulens genlerini taşıdığı belirlendi. S. Infantis suşlarının %74.55'inin 1 ve 2 no'lu gen paternlerinde dağılım gösterdiği tespit edildi. Bu çalışmada sopE2 virulens geni, S. Infantis suşlarında ilk kez araştırıldı. Broiler kümesleri ve karkastan izole edilen S. Infantis suşlarının baskın gen paternlerinde yer alması, damızlık ve yumurtacı kümeslere ait S. Infantis suşlarından hiçbirinin bu paternlerde yer almaması; S. Infantis'in broiler kümeslere damızlık kümesler dışındaki başka çevresel faktörler aracılığıyla girdiğini gösterdi. S. Typhimurium ve S. Enteritidis suşlarıyla karşılaştırıldığında, S. Infantis suşlarındaki sipA, sipD, sopD, ssaR, sopB, sopE, sifA ve sitC genlerinin varlığı benzer bulunurken; sopE2, spvC ve pefA gen varlığında önemli farklılıklar tespit edildi. S. Infantis suşlarında virulensle ilişkili genlerin araştırıldığı bu çalışma; tavuklarda Salmonellozis patogenezi üzerine yapılacak araştırmalara detaylı epidemiyolojik veri sunmaktadır.
Description
Keywords
Kanatlı orijinli salmonella infantis suş, virulens gen